Merkez’in amacı; Bugünkü enerji kaynaklarının ve onların üretim merkezlerinin çevreye olumsuz etkilerini giderici araştırma ve geliştirme çalışmaları yapmak, yaptırmak, yeni yöntemler geliştirmek, Temiz enerji üretme, temiz enerji kaynaklarına yönelme konularında araştırmalar yapmak, yeni yöntemler geliştirmek, yapılan çalışmalara katkıda bulunmak ve bu çalışmaları isteklendirici etkinliklerde bulunmak, Yeni ve temiz enerji konularında çalışanların aralarındaki iletişimi artına etkinliklerde bulunmak, bu konularda yapılan çalışmaları yaymak ve duyurmak, Yeni ve temiz enerji konularında bölgesel, ulusal ve uluslararası toplantılar yapmak, Hacettepe Üniversitesi'nde ilgili Bölüm'ler arasında yeni ve temiz enerji konuların da yapılan araştırma ve geliştirme çalışmalarını, gelen istekler doğrultusunda, yönlendirici ve birleştirici düzenlemeler yapmak, Yeni ve temiz enerji konularında çalışan ulusal ve uluslararası kurum ve kuruluşlarla ilişkiler kurmak, var olan ilişkileri geliştirmek, ortak çalışmalar yapmak, bilimsel ve teknik bilgi ve hizmet alışverişi yapmak, Gerek kamu, gerekse özel sektörün yeni ve temiz enerji ile ilgili işleklerim projelendirmek, verilen projeleri değerlendirmek ve sonuçlandırmak, Kamuoyunu, yeni ve temiz enerji konularında bilinçlendirin, aydınlatıcı etkinliklerde bulunmak, Hacettepe Üniversitesinin ilgili kurumlan ile işbirliği yaparak yeni ve temiz enerji konularında her düzeyde öğrenci, öğretim elemanı ile diğer personelin eğitimlerinde yardımcı olmak, Yeni ve temiz enerji konuları ile ilgili gerekli laboratuar ve birimleri kurmak, geliştirmektir.